Os primeiros sinais na história foram do século 16, ainda na época em que o padre Anchieta andava por estas bandas. No entanto, a construção da Capela de São Miguel Arcanjo, nos moldes que conhecemos atualmente, só ocorreu no início do século 17. É com base nesta arquitetura que se desenvolve o trabalho de recuperação deste que é um dos pontos mais famosos de São Miguel Paulista, na zona leste. Para os moradores da região, a retomada deste marco pode colocar o bairro no mapa de São Paulo, já que boa parte entende que a cidade dá as costas para eles.
Ouça a entrevista do arquiteto Alessandro Pompei, responsável pelo trabalho de reforma da capela, ao CBN SP:
Mílton Jung 
Olá!!Realmente este trabalho de recuperação é de muita importância, sou morador do bairro, um dos mais antigos da cidade de São Paulo.A capela Também conhecida como Capela dos Índios que participaram da construção juntamente com os Jesuítas conserva-se totalmente original com paredes em taipa de pilão, mantém sua simplicidade.Vale lembrar que alí era uma aldeia chamada Uruaí, segundo informações na restauração estará incluso as imagens religiosas e pinturas sacras e a construção de um museu onde ficarão alocados objetos como moedas do século XIX cerâmicas e outros ítens históricos encontarados nas escavações durante a reforma.
abraços…
Marcos Paulo Dias.